MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015850	GTG	2	6	169279	169284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780912
3002	NC_015850	TAC	2	6	169327	169332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780912
3003	NC_015850	GAC	2	6	169339	169344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3004	NC_015850	GAA	2	6	169365	169370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780912
3005	NC_015850	A	6	6	169369	169374	100 %	0 %	0 %	0 %	340780912
3006	NC_015850	GAC	2	6	169429	169434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3007	NC_015850	AAG	2	6	169471	169476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780912
3008	NC_015850	CGT	2	6	169482	169487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3009	NC_015850	CTG	2	6	169522	169527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3010	NC_015850	GAA	2	6	169543	169548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780912
3011	NC_015850	CGC	2	6	169584	169589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780912
3012	NC_015850	AAG	2	6	169609	169614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780912
3013	NC_015850	GCC	2	6	169663	169668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780912
3014	NC_015850	CTGG	2	8	169689	169696	0 %	25 %	50 %	25 %	340780912
3015	NC_015850	CGGG	2	8	169758	169765	0 %	0 %	75 %	25 %	340780912
3016	NC_015850	GGC	2	6	169932	169937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780912
3017	NC_015850	GGCCG	2	10	169969	169978	0 %	0 %	60 %	40 %	340780912
3018	NC_015850	AGC	2	6	170006	170011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3019	NC_015850	GCA	2	6	170082	170087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3020	NC_015850	GCC	2	6	170098	170103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780912
3021	NC_015850	CG	3	6	170208	170213	0 %	0 %	50 %	50 %	340780912
3022	NC_015850	CAC	2	6	170293	170298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780912
3023	NC_015850	ATC	2	6	170302	170307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780912
3024	NC_015850	G	6	6	170313	170318	0 %	0 %	100 %	0 %	340780912
3025	NC_015850	ATC	2	6	170362	170367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780912
3026	NC_015850	C	6	6	170394	170399	0 %	0 %	0 %	100 %	340780912
3027	NC_015850	AGG	2	6	170513	170518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780912
3028	NC_015850	GCG	2	6	170524	170529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780912
3029	NC_015850	GCCAAG	2	12	170683	170694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3030	NC_015850	CTG	2	6	170752	170757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3031	NC_015850	TTG	2	6	170768	170773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780912
3032	NC_015850	CCA	2	6	170798	170803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780912
3033	NC_015850	CGGG	2	8	170808	170815	0 %	0 %	75 %	25 %	340780912
3034	NC_015850	GGA	2	6	170871	170876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780912
3035	NC_015850	GAG	2	6	170923	170928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780912
3036	NC_015850	GC	3	6	170934	170939	0 %	0 %	50 %	50 %	340780912
3037	NC_015850	GGT	2	6	170940	170945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780912
3038	NC_015850	GCG	2	6	170962	170967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780912
3039	NC_015850	AGC	2	6	170971	170976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3040	NC_015850	GCG	2	6	171019	171024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780912
3041	NC_015850	TGC	2	6	171057	171062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780912
3042	NC_015850	GCAA	2	8	171065	171072	50 %	0 %	25 %	25 %	340780912
3043	NC_015850	GCC	2	6	171575	171580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780913
3044	NC_015850	AAC	2	6	171623	171628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780913
3045	NC_015850	ACC	2	6	171629	171634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780913
3046	NC_015850	TCC	2	6	171645	171650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780913
3047	NC_015850	TCCA	2	8	171766	171773	25 %	25 %	0 %	50 %	340780913
3048	NC_015850	TC	3	6	171817	171822	0 %	50 %	0 %	50 %	340780913
3049	NC_015850	G	6	6	171912	171917	0 %	0 %	100 %	0 %	340780913
3050	NC_015850	CGG	2	6	171945	171950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780913
3051	NC_015850	GGC	2	6	172181	172186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3052	NC_015850	ACC	2	6	172196	172201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3053	NC_015850	CGG	2	6	172215	172220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3054	NC_015850	ATG	2	6	172251	172256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3055	NC_015850	GGAC	2	8	172284	172291	25 %	0 %	50 %	25 %	340780914
3056	NC_015850	GGC	2	6	172335	172340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3057	NC_015850	TGC	2	6	172371	172376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3058	NC_015850	TAT	2	6	172412	172417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780914
3059	NC_015850	TGA	2	6	172497	172502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3060	NC_015850	GGA	2	6	172540	172545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780914
3061	NC_015850	GCC	2	6	172556	172561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780914
3062	NC_015850	GGC	2	6	172633	172638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3063	NC_015850	GGT	2	6	172653	172658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780914
3064	NC_015850	CAT	2	6	172696	172701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3065	NC_015850	CAA	2	6	172705	172710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780914
3066	NC_015850	CTG	2	6	172883	172888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3067	NC_015850	TGGA	2	8	172895	172902	25 %	25 %	50 %	0 %	340780914
3068	NC_015850	GTG	2	6	172907	172912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780914
3069	NC_015850	CGG	2	6	172947	172952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3070	NC_015850	CCA	2	6	173001	173006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3071	NC_015850	CCA	2	6	173088	173093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3072	NC_015850	TCG	2	6	173097	173102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3073	NC_015850	GCT	2	6	173152	173157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3074	NC_015850	GCC	2	6	173216	173221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780914
3075	NC_015850	ATG	2	6	173270	173275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3076	NC_015850	GAC	2	6	173294	173299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3077	NC_015850	CAA	2	6	173320	173325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780914
3078	NC_015850	TCA	2	6	173406	173411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3079	NC_015850	ATG	2	6	173417	173422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3080	NC_015850	TCG	2	6	173451	173456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3081	NC_015850	GGC	2	6	173553	173558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3082	NC_015850	CGG	2	6	173607	173612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3083	NC_015850	CCTGCT	2	12	173665	173676	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	340780914
3084	NC_015850	TCA	2	6	173763	173768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3085	NC_015850	CAT	2	6	173830	173835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3086	NC_015850	CAG	2	6	173969	173974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3087	NC_015850	CCA	2	6	173985	173990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3088	NC_015850	CTG	2	6	174014	174019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3089	NC_015850	TGA	2	6	174033	174038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3090	NC_015850	C	6	6	174112	174117	0 %	0 %	0 %	100 %	340780914
3091	NC_015850	CAG	2	6	174128	174133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3092	NC_015850	CTG	2	6	174134	174139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3093	NC_015850	GCC	2	6	174170	174175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780914
3094	NC_015850	GAA	2	6	174277	174282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780914
3095	NC_015850	CGG	2	6	174292	174297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3096	NC_015850	GA	3	6	174370	174375	50 %	0 %	50 %	0 %	340780914
3097	NC_015850	GGGAA	2	10	174390	174399	40 %	0 %	60 %	0 %	340780914
3098	NC_015850	AGCG	2	8	174410	174417	25 %	0 %	50 %	25 %	340780914
3099	NC_015850	GAT	2	6	174453	174458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3100	NC_015850	GCC	2	6	174725	174730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780915
3101	NC_015850	GACC	2	8	174744	174751	25 %	0 %	25 %	50 %	340780915
3102	NC_015850	TCCC	2	8	174783	174790	0 %	25 %	0 %	75 %	340780915
3103	NC_015850	CCG	3	9	174823	174831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780915
3104	NC_015850	AGT	2	6	174865	174870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780915
3105	NC_015850	ATC	2	6	175006	175011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780915
3106	NC_015850	CGG	2	6	175050	175055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780915
3107	NC_015850	CAAT	2	8	175074	175081	50 %	25 %	0 %	25 %	340780915
3108	NC_015850	CTT	2	6	175144	175149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780915
3109	NC_015850	TGC	2	6	175194	175199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780915
3110	NC_015850	GAA	2	6	175360	175365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780915
3111	NC_015850	TCG	2	6	175433	175438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780915
3112	NC_015850	CAG	2	6	175468	175473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780915
3113	NC_015850	AGTTG	2	10	175479	175488	20 %	40 %	40 %	0 %	340780915
3114	NC_015850	AGA	2	6	175521	175526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780915
3115	NC_015850	GC	3	6	175541	175546	0 %	0 %	50 %	50 %	340780915
3116	NC_015850	ATG	2	6	175888	175893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780916
3117	NC_015850	AGA	2	6	175901	175906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780916
3118	NC_015850	GAT	2	6	175942	175947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780916
3119	NC_015850	ACCT	2	8	176003	176010	25 %	25 %	0 %	50 %	340780916
3120	NC_015850	GGCC	2	8	176019	176026	0 %	0 %	50 %	50 %	340780916
3121	NC_015850	TCCC	2	8	176054	176061	0 %	25 %	0 %	75 %	340780916
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3360	NC_015850	CTGCT	2	10	192423	192432	0 %	40 %	20 %	40 %	340780933
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3484	NC_015850	CGAT	2	8	201400	201407	25 %	25 %	25 %	25 %	340780940
3485	NC_015850	TGC	2	6	201453	201458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780940
3486	NC_015850	TTG	2	6	201461	201466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780940
3487	NC_015850	GTC	2	6	201515	201520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780940
3488	NC_015850	CCG	2	6	201579	201584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780940
3489	NC_015850	GGCCA	2	10	201590	201599	20 %	0 %	40 %	40 %	340780940
3490	NC_015850	CGT	2	6	201672	201677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780941
3491	NC_015850	TGG	2	6	201697	201702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780941
3492	NC_015850	AGG	2	6	201716	201721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780941
3493	NC_015850	CGG	2	6	201789	201794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780941
3494	NC_015850	GGC	2	6	201858	201863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780941
3495	NC_015850	TGG	2	6	202035	202040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780941
3496	NC_015850	CTC	2	6	202077	202082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780941
3497	NC_015850	GTG	2	6	202269	202274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780941
3498	NC_015850	GCA	2	6	202314	202319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780941
3499	NC_015850	GAT	2	6	202565	202570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780942
3500	NC_015850	GAA	2	6	202589	202594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780942

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